Aplikacja Lookout domyślnie skanuje aplikacje instalowane ze sklepu Google Play, a dzięki funkcji Bezpieczeństwo plików skanuje także pliki urządzenia pochodzące z innych źródeł.
W ustawieniach aplikacji Lookout znajduje się zaznaczona domyślnie opcja „Bezpieczeństwo plików”. (Menu > Ustawienia > Bezpieczeństwo plików). Dzięki niej są automatycznie skanowane instalowane pliki — takie jak pliki umieszczane na karcie SD lub przenoszone. („Przenoszenie” — w przeciwieństwie do „przekazywania” i „pobierania” — oznacza proces transferu plików między dwoma urządzeniami lokalnymi, takimi jak komputer i urządzenie przenośne).
Funkcja ta jest idealna dla osób, które zezwoliły w ustawieniach systemu Android na instalację aplikacji spoza oficjalnych sklepów, ponieważ umożliwia ona wykrywanie zagrożeń przed instalacją aplikacji lub plików. Umożliwia także aplikacji Lookout aktywne monitorowanie systemu plików pod kątem zmian oraz skanowanie zdarzeń odczytu karty SD lub przekazywania plików.